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Projet de recherche

 Dynamiques évolutives de l’adaptation à l’hôte chez les champignons pathogènes de plantes

• Encadrants : François Delmotte (UMR SAVE), Cyril Dutech (UMR BIOGECO), Marie Foulongne-Oriol (UR MYCSA)  
• Financement : GPR Bordeaux Plant Sciences (Université de Bordeaux)
• Période: 01/06/2022 – 31/05/2024

Description du projet

L’objectif du projet est d’étudier la dynamique évolutive de l’adaptation à l’hôte chez les champignons pathogènes de plantes, en se concentrant sur trois espèces : Cryphonectria parasitica (Chancre du châtaignier), Plasmopara viticola (Mildiou de la vigne) et Fusarium graminearum (Fusariose du blé), qui sont responsables de pertes conséquentes dans des cultures majeures. A partir de données génomiques et de données de phénotypage, des approches de scan génomique seront développées afin de détecter des signatures de sélection liées à l’adaptation à l’hôte en prenant en compte les caractéristiques biologiques propres à chaque modèle.

Formation et expérience

• 2021-2022 : Post-Doctorat au CIRAD (Montpellier), UMR PHIM, avec Jean Carlier (CIRAD)

Étude de l’adaptation des populations de Pseudocercospora fijiensis de Guadeloupe vis-à-vis de géniteurs résistants utilisés par le CIRAD pour l’amélioration variétale du bananier.

• 2017-2021 : Thèse co-financée au CIRAD (Montpellier), UMR PHIM, encadrée par Jean Carlier (CIRAD), Catherine Abadie (CIRAD) et Jaime Aguayo (ANSES)

Étude de l’adaptation aux résistances variétales chez le champignon Pseudocercospora fijiensis, agent causal de la maladie des raies noires du bananier.

Publications significatives

Dumartinet, T., Ravel, S., Roussel, V., Perez-Vicente, L., Aguayo, J., Abadie, C., & Carlier, J. (2021). Complex adaptive architecture underlies adaptation to quantitative host resistance in a fungal plant pathogen. Molecular Ecology, 31, 1160-1179. https://doi.org/10.1111/mec.16297

Dumartinet, T., Abadie, C., Bonnot, F., Carreel, F., Roussel, V., Habas, R., Martinez, R. T., Perez‐Vicente, L., & Carlier, J. (2020). Pattern of local adaptation to quantitative host resistance in a major pathogen of a perennial crop. Evolutionary Applications, 13(4), 824-836. https://doi.org/10.1111/eva.12904