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Projet de recherche

Étude de l'impact de la sécheresse sur l’interaction entre la plante et l’infection fongique

Encadrants : Chloé Delmas (UMR SAVE), Marie Foulongne-Oriol (UR MYCSA)

Financement : GPR Bordeaux Plant Sciences (Université de Bordeaux)

Période : 15/07/2022 – 15/07/2025

Description du projet :

L’objectif de ce projet est de mieux caractériser les effets de la sècheresse sur les interactions entre la plante et les champignons pathogènes. Pour répondre à cette question, deux modèles d’études ont été choisis : la vigne (Vitis vinifera, Sauvignon Blanc) en condition de sècheresse et de maladie de l’Esca, et le blé (Triticum aestivum) en condition de sècheresse et d’infection par Fusarium graminearum responsable de la fusariose de l’épi. Deux variétés de blé tendre d’hiver seront également testées, l’une plutôt sensible (Pibrac) et l’autre plutôt résistante (Oregrain) à la fusariose de l’épi. Pour chaque modèle, différents traits écophysiologiques (statut hydrique, conductance stomatique, assimilation du carbone, croissance, etc.) seront suivis, et des analyses transcriptomiques (metaRNAseq pour l’Esca de la vigne et dualRNAseq pour la fusariose de l’épi) et métabolomiques seront réalisées.  Ces différentes analyses permettront notamment d’obtenir des informations sur la tolérance et la physiologie de la plante, ainsi que la réponse fonctionnelle de la plante et des champignons pathogènes au stress hydrique ou aux deux stress cumulés.

Formation et expérience

• 10/2020 – 06/2022 Post-Doctorat UR 4358 Glycobiologie et Matrice Extracellulaire Végétale (GlycoMEV), Université de Rouen Normandie. Encadrante : Isabelle Boulogne. Analyse transcriptomique et protéomique du soja en réponse à des biostimulants
• 09/2017 – 09/2020 Doctorat UR 4358 Glycobiologie et Matrice Extracellulaire Végétale (GlycoMEV), Université de Rouen Normandie. Encadrantes : Isabelle Boulogne et Marie-Laure Follet-Gueye. Analyse génomique de l’ADN extracellulaire du « Root Extracellular Trap » (RET) et caractérisations omiques des « root Associated Cap-Derived Cells » (AC-DC) chez le soja Glycine max (L.) Merr., 1917.

Publications significatives

Chambard M, Ben Mlouka MA, Jing L, Plasson C, Cosette P, Leprince J, Follet-Gueye M-L, Driouich A, Nguema-Ona E, Boulogne I.  Elicitation of Roots and AC-DC with PEP-13 Peptide Shows Differential Defense Responses in Multi-Omics. Cells 2022. https://doi.org/10.3390/cells11162605

Chambard M, Plasson C, Derambure C, Coutant S, Tournier I, Lefranc B, Leprince J, Kiefer-Meyer M-C, Driouich A, Follet-Gueye M-L, Boulogne I. (2021) New Insights into Plant extracellular DNA. A study in soybean Root Extracellular Trap (RET). Cells. https://doi.org/10.3390/cells10010069